主要原因在于大部分预言中的过渡物种都没有找到完整化石，包括与人类祖先关系密切的南猿和古猿及古类人猿和直立行走的猿人之间的完整过渡化石。没有找到。
生物进化论没法解释寒武纪时期“动物大爆炸”现象，那么多的高等生物，忽然间莫名其妙地一下子就出现了，没有进化过程，直接动摇了生物进化论的基础。
很多人质疑进化论的原因主要有以下几点：
首先，进化论作为一项科学理论，缺乏直接证据，例如没有发现中间过渡物种化石等；
其次，进化论的假设条件过于苛刻，例如物种变异需要基因突变等；
最后，进化论无法解释一些现象，例如生物大爆炸等。不过，随着科学技术的不断发展，越来越多的证据证明进化论是正确的。因此，我们应该客观看待进化论，尊重科学证据，并不断探索和发现新的科学知识。
