聚合酶指的是DNA聚合酶。连接酶即DNA连接酶，两者主要的区别是模板不同、连接方式不同和作用不同。
1、模板不同：DNA连接酶是不需要模板的，是生物体内存在的一种酶，而DNA聚合酶需要以原来的DNA为模板，如果不能获得原来的DNA模板就无法进行复制，也无法发挥它的作用。
2、连接方式不同：DNA连接酶主要是通过连接两个DNA片段，将两个分离的DNA在特定的末端连接，而DNA聚合酶是通过将原来的DNA进行复制，然后将复制以后的DNA与原来的DNA进行连接，最终能够形成 DNA链。
3、作用不同：DNA聚合酶可以复制DNA，起到修复DNA的作用，而DNA连接酶主要的作用是可以连接DNA片段，形成磷酸二酯键。
