银魂式神篇的结局是一个带着遗憾的完美结局。
在银魂的最终篇章中，故事分为两个部分：银之魂篇和两年后篇。银之魂篇主要讲述了银时和松阳合力阻止龙脉爆发的故事，期间万事屋全员和松阳共同努力，最终成功阻止了龙脉爆发，使大家的生活回到了正轨。随后，众人和老师告别，回归了普通的日常。
两年后篇则展现了银时和松阳因阻止龙脉爆发而被困在虚空中，江户的人们误以为他们已经牺牲。两年后，江户迎来了新的时代，万事屋的新八和神乐也各自有了新的生活，但他们心中始终有一个空缺，那就是银时。在一次偶然的机会中，新八发现了银时的信号，于是他和神乐决定去寻找他。他们在虚空中找到了银时和松阳，却发现他们已经被虚化了，并且还要面对虚的最终形态——辰马。经过一番激战，他们终于打败了辰马，但却发现自己无法回到原来的时空。因此，他们决定用虚的力量创造一个新的时空，让自己和江户的人们能够再次相见。虽然他们成功地做到了这一点，但却付出了一个代价：他们的存在只能以数据的形式保存在江户的天空中，而不能真正回到江户的生活中。他们只能通过一个虚拟的屏幕，看到江户的人们的生活，和他们说话。他们给江户的人们留下了一封信，告诉他们自己的情况，也告诉他们自己的心意，表示即使他们现在存在在一个没有他们的天空下，也请不要哭泣，他们会在他们的天空下，与他们在一起1。
这样的结局虽然带着遗憾，但也展现了友情和牺牲的精神，为这部漫画画上了一个圆满的句号。空知英秋通过这种方式，让银魂的故事以一种特殊的方式继续着他们的友情，而没有让万事屋的三人组分开或真正在一起。
