主要依据光合色素的种类、细胞中贮藏养分的种类及其它特征，分为八个门。现介绍以下三个门。
①蓝藻门
是一类最原始的植物，细胞内无真正的细胞核（为原核细胞），对研究生物的起源有重要的意义。细胞中无质体，色素分散于原生质中，光合色素中无叶绿体，主要是叶绿素、胡萝卜素和蓝藻素，合成的营养物质为蓝藻淀粉和蓝藻颗粒体。繁殖是靠细胞分裂。
代表植物：葛仙米
②绿藻门
植物体具多种类型，细胞内具真核，内含叶绿体，与高等植物相同，合成的营养物质为淀粉。单细胞藻类依靠细胞分裂，有些种类生活史中有明显的世代交替现象，如水绵。绿藻门是藻类植物中最大的一门，约有350属，5000——8000种，多分布于淡水中。
代表植物：水绵
③褐藻门
为多细胞植物体，是藻类中最高一级的一类，外形有丝状体、片状体和膜状体。内部构造较复杂，有组织分化，含有叶绿素、胡萝卜素和叶黄素，植物体呈褐色。贮藏物为褐藻淀粉、甘露醇、油类等。生活方式基本与绿藻相似。约有250属1500种，生活在海水中，是构成海底“森林”的主要类群。
代表植物：海带
