科学家们在细菌体内发现了超10种免疫机制，是已知免疫防御体系的两倍多。
1）“Theoris”系统（以埃及负责分娩、生育的保护神而命名）包含一个TLR受体区域，负责调控细胞内信号蛋白的互作，之前研究证实它与调控RNA干扰（RNAi）的原核Argonaute基因有关联。
2）“Zorya”系统被发现含有一个质子通道的组成元素。“我们初步证实，一旦细菌被感染，质子通道可能会‘自杀’，从而促使细胞膜去极化。”
首先细菌是单细胞生物，而器管都是有很多细胞组成，所以细菌没有免疫器官，另外细菌不是上述免疫细胞，所以细菌没有免疫细胞，最后抗体是浆细胞分泌的，溶菌酶由溶酶体专门负责分泌，而细菌中是没有溶酶体的，所以细菌内部也是没有免疫活性物质的。综上可得细菌内是没有免疫系统的。
