生病，秦钟因为在秦可卿出殡时跟随贾宝玉王熙凤住在馒头庵，与馒头庵中的尼姑智能儿偷情，后来回家后智能从馒头庵逃出来找秦钟，被秦钟父亲发现，秦钟父亲赶走了智能，因此气死。秦钟因本身在馒头庵身体虚亏，回家后又遭受打击，愧对智能又内疚父亲亡故，一病不起。
先天不足，加上放纵欲望，导致秦钟的身体出现了问题，所以他开始修养身心，也不去贾府学堂上学，一个人在家调养。
秦钟虽然跟贾宝玉一起“离经叛道”，但他并不像贾宝玉那般，是个彻彻底底的叛逆者。贾宝玉有着“从前碌碌却因何，回头试想真无趣”的觉悟，这导致他在黛玉病逝、家族被抄之后，选择了顿悟，而不是像秦钟那般被各种压力压迫，一病不起。
