1、自然孵化
甲鱼下蛋之后，孵化的方式有两种，其中一种是自然孵化，也就是由母甲鱼自发进行的一种孵化方式，野生的甲鱼一般采用这种方式，但是由于甲鱼处于野外的环境中，温度因素难以调节，孵化成功率较低。
2、人工孵化
人工饲养的甲鱼，一般采用人工孵化的方式，先准备一个孵化箱，可以使用塑料箱或者杉木箱，然后在里面铺上一些沙子、海绵等，再把甲鱼蛋放进去，温度控制在31-33摄氏度左右，孵化时间为一个月以上。
温度.最好控制在28℃～31℃,不得高于34℃,不得低于26℃.湿度.最好控制在80％～82％,砂子含水量最好控制在7％～8％,不得低于5.3％,不得高于25.0％, 孵化期间,应每天定期检查沙子的湿度.检查时,可用手轻轻扒开沙子, 观察含水沙层离表面的深度.如果直到靠近蛋才出现湿润沙层,则用喷雾器在沙子表面喷水,使细沙层(5～6厘米 厚)略带湿润即可,切不可在高温下大量洒水.一般2～3天洒水1次.通气.孵化期间,应防止表层板结而使蛋不通气而闷死. 龟蛋孵化临近出苗时,用小耙疏松表层沙土,以利稚龟出壳.出壳的稚龟有趋水习性,这时要在孵化池的一端安置一个盛有半盆水的脸盆,便于稚龟爬入盆中.刚出壳的稚龟重3～7克,背部带土黄色,粗看似古代铜钱.待稚龟脐孔封闭、蛋黄吸完后可放入稚龟池饲养. 在22～33℃范围内，温度越高，胚胎发育愈快，孵化的时间愈短；反之，温度、偏低，胚胎发育较慢，孵化的时间愈长。当温度达23～27℃时，绝大部分稚龟呈雄性；而当温度在30～33℃时，绝大部分稚龟呈雌性。
