纳土纳群岛由272个岛组成，位于纳土纳海，西为马来西亚和加里曼丹岛，纳土纳海本身属于南中国海的一部分。主要岛包括纳土纳大岛（Natuna Besar）、南纳土纳群岛（South Natuna archipelago）、淡美兰群岛（Tambelanarchipelago）和巴达斯群岛（Badas Islands）。
南纳土纳群岛主要包括Serasan、潘姜（Panjang）和苏比岛（Subi）。阿南巴斯群岛（Anambas archipelago）位于纳土纳群岛以西几百公里处，主要由Terempa、Matak 和哲马贾岛（Jemaja Andriabu island）组成，有的人还把纳土纳群岛也算入阿南巴斯群岛。地理坐标：4°00′N，108°15′E
