常见的复合益生菌菌种包括嗜酸乳杆菌、双歧杆菌、嗜热链球菌、嗜酸乳杆菌、球形乳杆菌、乳酸菌、酪酸菌等。
此外，还有高活性复合微生物菌剂中配比共有10种菌，包括枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌、嗜酸乳杆菌、侧孢芽孢杆菌、5406放线菌、光合细菌、胶冻样芽孢杆菌、绿色木霉菌等。
组合菌剂中的每一种菌都有其特有的作用。 复合微生物菌剂的原菌中的高固氮活性的地衣芽孢杆菌是自有专利产品,其余部分均来自中国农业微生物菌种保藏管理中心。 菌种扩繁培养的菌株高活性,复合菌产品活菌数达到20亿个/克,远高于国家标准2亿个/克 。
生物菌
枯草芽孢杆菌：代谢产生枯草菌素、多粘菌素、短杆菌肽等活性物质,对致病菌有抑制作用，如对作物的黄萎病有一定防治效果。
地衣芽孢杆菌： 抑制土壤中病原菌的繁殖和对植物根部的侵袭,减少植物土传病害;提高种子的出芽率和保苗率,预防种子自身的遗传病害,提高作物成活率,促进根系生长;改良土壤,改善土壤团粒结构,提高土壤蓄水能力 。
1、EM复合菌由双岐菌、乳酸菌、芽孢杆菌（地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、胶质芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌等）、光合细菌、酵母菌、放线菌、醋酸菌等复合有益菌群,采用先进工艺生产,有效保证了有效活菌的数量和活性,可以抑治有害病菌的滋生,促进土壤微生态环境的平衡。
2、抗重茬、防病害:有益菌及其分泌物可以杀灭土壤中的有害菌及病毒,有效减少作物根腐病、茎基腐病、立枯病、青枯病等病害的发生,对重茬连作障碍有预防作用。
3、培肥地力、促进生长
