动物防疫条件合格证在县级地方人民政府兽医主管部门办理。
另外,动物防疫条件合格证也是办理工商营业执照和养殖贷款的前置条件。动物养殖场(养殖小区)、屠宰场等相关场所要想办工商营业执照和养殖贷款必须先办理动物防疫条件合格证。