FATE线 梦的延续
士郎与SABER破坏圣杯，SABER完成心愿，回到临死前的那一刻，在骑士贝迪威尔面前合上双眼。
UBW线 Brilliant Years(true end)
ARCHER在战斗结束后消失，SABER破坏圣杯后亦消失。一年后凛前往伦敦时钟塔留学，士郎作为凛的徒弟一同前往伦敦。
UBW线 Sunnny Day(good end)
ARCHER在战斗结束后消失,士郎清醒后发现SABER由于和凛的契约而留在了现世。三人从此开始幸福的生活。
HF线 樱之梦（normal end）
士郎拯救了樱，用最后一口气投影摧毁大圣杯，樱独自在卫宫邸一辈子守候士郎。
HF线 春天回归（true end）
士郎拯救了樱，当士郎准备用最后一口气投影摧毁大圣杯时，依莉雅出现并以自己为祭品关闭了大圣杯，然后以接近第三法的力量将士郎的灵魂留了下来。两年后凛从伦敦回乡休假，士郎已通过人偶恢复原样。最后士郎，樱，凛，RIDER四人赏樱。
Last Episode（PS2所增加的隐藏结局）
经过两个人漫长的等待，SABER与士郎终于再次相见。
结局是士郎和SABER把圣杯给销毁了，士郎把那个魔术师灭了，SABER把英雄王个削了，最后SABER回到了自己的世界，并且把石中剑丢入湖里，并沉沉的睡去了（或许不会醒了吧），士郎依旧在自己的世界里生活，不过时常想起SABE
