京东将大陆市场分为七个大区——华北、华东、华南、东北、华中、西南和西北，并且在北京、上海、广州、沈阳、武汉、成都和西安这7个中心城市建立了物流中心并设立中心仓，这是物流的第一级；由于覆盖区域面积巨大，在济南、南京、重庆
等城市设立前置仓，存放周转快的商品，而不会是全品类存放，这样做是为加快对二三线以下城市用户的反应速度，加快时效，提升用户体验，这是第二级；再往下是分拨中心，第四级是中转站，而第五级即终端级便是配送站。配送员从站点出发，用面包车、三轮车、摩托车进行配送。
1、京东商城总部在北京。库房有：北京、上海、广州、沈阳，西安，武汉，成都七大库存物流中心。
截至2015年年底，在全国拥有7大京东物流中心，在44座城市运营166个大型仓库。
