从外型上区分：乳山生蚝属于太平洋生蚝，其具有左右两扇贝壳，右壳较小而扁平，左壳凹陷较深，鳞片排列紧密。壳形变化大，呈长圆形或长三角形。
而深海生蚝大多以近江生蚝为主，贝壳大，坚厚，右壳略扁平，较左壳小。一般多呈圆形、长卵圆形或三角形。
从外壳上分辨：乳山生蚝属于深水生蚝，养殖方式多为筏式养殖，即将生蚝苗和附着器一起装在网笼内并利用缆绳固定在海底进行养殖的方式，因此乳山生蚝外壳颜色多偏乳白色。
深海生蚝属于深水生蚝，较多养殖于水入海的河口。湛江生蚝长期生长在浅水区域会有藻类依附在生蚝身上，因此湛江生蚝外壳颜色偏绿、偏深。
