1：系结构区别：实生苗具有坚实的根系，经过自然发育的种苗根系发达，生命力强；而扦插苗的根系相对较弱，会比实生苗更加脆弱。
2: 抗性方面区别：实生苗在逆境环境下恢复力强，对于缺水、刮风和不良土壤的适应性较强；而扦插苗在不适应的环境下生长往往会受到更多的限制。
3: 生长速度区别：实生苗一般在生长初期会较慢，而扦插苗在植株萌发后会极快速生长，这也是一些商业公司更倾向于扦插苗的原因之一。
根部形态：实生苗的根系通常较发达、粗壮，呈自然分枝状态，根须较多。而扦插苗的根系较为细弱，根数相对较少，没有自然分枝。
叶片形态：实生苗的叶片通常较大，形状和颜色均匀一致。而扦插苗的叶片通常较小，形状和颜色可能有一定的变异。
茎部特征：实生苗的茎部通常较为粗壮，直立稳固。而扦插苗的茎部较为柔软，容易倾斜或弯曲。
