辣椒苗一般是深栽比较好（大苗宜深栽，小苗宜浅栽），因为辣椒的根系入土较浅，特别是温室内进行垄作、覆盖地膜的植株，其根系大多集中在浅土层，结果时容易倒伏。
适当深栽还可以促进下胚轴产生不定根，增加植株的生根量，这有利于提高植株吸收水分、营养的能力。
辣椒种深一点点，不能浅栽，因辣椒杆细，长大后上部沉，有受风吹倒的可能。
健康的辣椒苗子一般在定植时还会带有两片对生的子叶，定植时泥土不要覆盖住子叶，并且与土面有2-3cm的距离为宜。辣椒也可以在有一点阴凉的地方生长。但是要避免把辣椒种在没有任何阳光的地方。如果你院中的土壤很硬或者下雨的时候容易灌满水，那么最好修一个抬高的苗床来种辣椒
