木瓜有很多种分类，根据果实的形状、大小、口感、颜色等特征，可以将木瓜分为长形木瓜、圆形木瓜、短形木瓜、黄色木瓜、绿色木瓜、红色木瓜、酸甜木瓜、柔软木瓜等。此外，根据木瓜的产地，还可以将木瓜分为南方木瓜、北方木瓜等。木瓜的分类还可以根据其品种，如芒果木瓜、山竹木瓜、火龙果木瓜、苹果木瓜等。
1、皱皮木瓜。皱皮的木瓜表面上是比较皱一点，但是吃起来是非常甘甜的，一般这种木瓜在成熟的7到10天就会出现皱皮的现象的了，比较适合做蜜饯、果酱和一些果汁等等，这些都是平时吃的关于木瓜主流产品的一些方式。
2、光皮木瓜。光皮木瓜对比其它的木瓜，它的优势在于比较有观赏价值，初夏赏花，秋季赏果，深秋夜色变红也很艳丽。实生苗5-8年后进入花果期，光皮木瓜的药效甚微。由于其果实木质无实用价值，果供观赏，因其果实干燥后仍然光滑，不皱缩，故名光皮木瓜，现在在很多单位会用这种木瓜种植作为绿化，小区也会见到有些。
3、毛叶木瓜。毛叶木瓜，对比其它的木瓜，它的特征就是一种灌木和小乔木，这种木瓜主要产于中国西南一带。落叶灌木至小乔木。果实卵球形或近圆柱形，先端有突起，长8～12cm，黄色有红晕，味芳香。9～10月成熟。果实入药，不可食用。耐寒力不及皱皮木瓜和光皮木瓜。也就是在冬季的时候几乎就没什么有了。
