挑选出个头大、体型好、色泽鲜艳、果肉厚实的进行留种，当第二至三果穗上的西红柿完全成熟后单独采摘，放在室内2-3天让其充分成熟，将预留做种的果实洗干净后切成凉拌，将其一同挖出来放在容器中发酵。
发酵好后用洗大米的方式搅拌，种子晾晒后装入布袋保存。
1、选株、选穗：：将长势较好、株高相当的植株当作留种苗，待第2-3个果穗上的果实成熟后，摘下果面光滑、脐小肉厚的果实留作种用。
2、挖籽：将种子连同胶液一同挖出，放入塑料盆中。
3、发酵：盖好盆盖，并在室内放置2-3天。
4、淘洗：将适量清水倒入种液中，拌匀后淘洗种子。
5、保存：将种子晒干，放在纸袋中保存，然后在标签上写明相关信息。
一、西红柿留种方法
1、选株
将长势良好、株高一致、花序着生部位适中、主要性状符合本品种特征特性的植株作为留种苗。

2、选穗
（1）选好单株后，采摘第2-3个果穗上面的成熟果实，并将色泽新鲜、果面光滑、果形大而整齐、脐小肉厚、蒂部无裂纹的果实留作种用。
（2）采摘后，将果实放置2-3天，促使它们充分成熟。

3、挖籽
洗净果实，于中部横切成两半，再将种子连同胶液一同挖出，倒在没有水的容器中（防止种子发芽）。

4、发酵
盖好盖子并在室内放置2-3天，待种液表面出现白色菌膜、种子与胶状物容易分离时，即代表已完成发酵。

5、淘洗
（1）将等量的清水倒入发酵好的种液中，随即充分搅拌。
（2）倒掉上层的浮液，再次添加清水，然后将种子淘洗2-3遍。
（3）若种子表面的胶状物不易脱落，可手动搓洗后再淘干净，淘净后摊放在纱布上晾晒，期间要定时翻动，让种子均匀干燥。

6、保存
将种子的含水量晒至12%以下时，装入纸袋或布袋中，然后在标签上写明品种、来源、质量、采种年月等信息，并挂在袋上，袋内也可保存一份，避免拿错。
