一个很简单的方法，就是看甲鱼的尾巴长度。公甲鱼的尾巴比较长，超过裙边的范围，而母甲鱼的尾巴则比较短，会缩在裙边里面。
另外公甲鱼比较凶猛，在交配时期，喜欢趴在母甲鱼的背上，咬着它的脖子。一般，一只公甲鱼要配上10只母甲鱼，所以母甲鱼身上常常有很多血淋淋的抓痕。虽然这个不能作为分辨公母甲鱼的最佳依据，但是也可以辅助辨别一下。
1、外观：公甲鱼和母甲鱼外观方面的区别是比较大的，有许多个方面可以区分它们。可以看它们的背甲，公甲鱼的背甲是比较长的椭圆形，背甲相对来说比较薄；母甲鱼则相反，它们的背甲是相对较圆的椭圆状，而且背甲比较厚。还可以看它们的尾巴，公甲鱼的尾巴是比较细长的，而母甲鱼的尾巴则是又短又粗。还可以看它们的后肢，距离比较宽的是母的，反之则是公的。
2、体重：若是甲鱼的年龄都相同，则可以通过体重来区分它们。一般来说，公甲鱼会重一些，而母甲鱼则会轻一些。从体重区分最好作为一个辅助措施，主要还是看它们的外观。
3、繁殖期表现：若是甲鱼都到了性成熟的年龄，并且正好处于繁殖期内的话，那么可以通过它们的表现来区分公母。在交配的过程中，公的甲鱼喜欢爬到母甲鱼的背上，有时候还喜欢咬母甲鱼的脖子。母甲鱼在会在公甲鱼的下方，可以通过这一点来区分公母。
