一、所属纲属不同
两栖动物属于两栖纲，爬行动物属于爬行纲。
二、构造不同
爬行类( Reptilia)心脏有两心房两心室，心室有不完全隔膜，体温不恒定，是真正适应陆栖生活的变温脊椎动物，并由此产生出恒温的鸟类和哺乳类。两栖动物拥有四肢的脊椎动物。两栖动物的皮肤裸露，表面没有鳞片。
三、生活环境不同
爬行动物的生活环境：成体大多数生活在陆地上，少数种类生活在水中。
两栖动物的生活环境：幼体在水中，成体陆地和水。
四、特征不同
两栖动物的特征：幼体生活在水中，用鳃呼吸；成体大多生活在陆地上，也可在水中游泳，用肺呼吸，皮肤可辅助呼吸。
爬行动物的特征：体表覆盖角质的鳞片或甲；用肺呼吸；在陆地上产卵，卵表面有坚韧的卵壳。
1、爬行动物产的卵是羊膜卵，而两栖动物产的是非羊膜卵；
2、爬行动物体表被覆鳞片、盾或甲，缺乏皮肤腺，皮肤没有呼吸功能；而两栖动物皮肤光滑，没有鳞片、盾或甲；皮肤具有呼吸功能3、爬行动物没有肺皮动脉，而两栖动物具有肺皮动脉；4、爬行动物的生活史中没有变态，而两栖动物则有变态过程。5、爬行动物的颈椎分化比较复杂，不仅有环椎、枢椎的分化，而且还有数枚颈椎，而两栖动物的颈椎仅有1枚环枢椎。两栖动物（学名：Amphibia）包括所有生没有卵壳的卵，拥有四肢的脊椎动物。两栖动物的皮肤裸露，表面没有鳞片，毛发等覆盖，但是可以分泌粘液以保持身体的湿润；其幼体在水中生活，用鳃进行呼吸，长大后用肺兼皮肤呼吸。两栖动物可以爬上陆地，但是不能一生离水，因为可以在两处生存，称为两栖。它是脊椎动物从水栖到陆栖的过渡类型。现在大约有三千多种两栖动物。两栖动物是冷血动物。爬行动物属于四足总纲的羊膜动物，是对蜥形纲及合弓纲除鸟类及哺乳类以外所有物种的通称。在生命进化的过程中，爬行动物占有极其重要的地位。由于它的胚胎可以在产于陆地上的羊膜卵中发育，使其繁殖和发育摆脱了对外界水环境的依赖，是真正的陆生脊椎动物。人们常见的蛇、龟、蜥蜴、鳄鱼等均属爬行动物。
