水温一直保持在50度的水有细菌吗（40度水长期恒温会滋生细菌吗）

可以啊，空气里到处都是细菌，肯定会进到水里的。要彻底灭菌的话，实验室里可以用一个大气压下的蒸汽灭菌，至少要115℃灭30min，或者120℃灭15min，你这个水水温太低了，不足以抑制细菌。