1、原料不同
花椒是芸香科灌木或小乔木植物青椒的干燥成熟果皮，主要产于我国四川、河北、山西等地；而胡椒的原料是热带植物胡椒树的果实，主要产于我国广东、海南等地。
2、外观不同
花椒颜色重，偏棕红色，晒干的花椒颜色更是发红，而且表面的有气孔，但没有瘤状的凸起物；胡椒是圆形的浆果，而且有黑胡椒和白胡椒之分，黑胡椒和白胡椒是采用不用时期的果实制成，主要有外观上颜色的不同，在功效上区别不大。
3、口感不同
胡椒带有特有的芳香味道，口感比较辣，在鲜辣中还带有一点苦涩味；而花椒尝起来很香，也很辣，不过辣中带着浓浓的麻味，也可以说是麻中带辣。
4、用途不同
花椒烹饪用途也十分宽泛，在各式红烧菜肴、卤味、泡菜、小菜以及烹饪肉类菜肴时，都可以使用；而黑胡椒多用来给腥味比较重的荤类食材去腥，白胡椒多用来烹制白肉类或者海鲜类食材。
胡椒和花椒有多种区别。
首先作用不同，花椒属云香型调料适用于多种食品的调料，而胡椒则最适合汤料。
再者花椒的食用部分是种实包皮，而胡椒食用部分则是籽实。
还有花椒颜色是青色或红色，而胡椒籽实的颜色有黑和白两种。
