苍蝇的幼虫叫蝇蛆。蝇蛆是蝇产卵在15-40℃数小时后孵化的，长约两厘米，通过蠕动行走，有三个龄期。1龄幼虫体长1-3毫米，仅有后气门。蜕皮后变为2龄，长3-5毫米，有前气门，后气门有2裂。再次蜕皮即为3龄，长5-13毫米，后气门3裂。蝇蛆体色在1-3龄由透明、乳白色变为乳黄色，直至成熟、化蛹。
蝇蛆为食杂性，在栖息处就地取食，有人曾在1.5平米的猪粪中发现蝇蛆和蛹多达7.64万个，动物性饲料、植物性饲料以至微生物中的蛋白质都是蝇蛆喜摄入的营养成分，食物的数量、质量、发酵温度以至含水量，都直接关系到蝇蛆的发育效果，3龄期蝇蛆发育成熟后即停止摄食，在低温15-20℃和低湿的条件下，常离开孳生场所，钻到附近泥土疏松处化蛹。
苍蝇的幼虫也被称为蛆，通常呈白色或浅黄色，身体长圆形，约为3-9毫米长。它们没有明显的头部或腿，但是有一些小刺来帮助它们在食物上移动。幼虫的身体表面有许多细小的呼吸孔，通过这些呼吸孔，它们可以吸入氧气并排出二氧化碳。幼虫在食物中生长和发育，一般在5-7天后变成成熟的苍蝇。它们是许多动物的重要食物来源，同时也是许多疾病的传播者。
