在《木府风云》中,木增和阿勒邱的结局是一起逃亡并最终重获自由。他们在与各种困难和障碍斗争后,成功逃离了木府,结束了他们在家族的压迫下的苦难生活。他们找到了属于自己的幸福,并且终于能够自由地选择自己的人生。