新鱼塘如果还没有养鱼的话，最好用生石灰来消毒，这种物质遇水后会产生大量的热，还会成为强碱，从而对鱼塘内的各类菌起到杀伤的效果。
如果已经养鱼，就不用生石灰了，可以用漂白粉或二氧化氯，但也有注意浓度，用得太多会产生药害，甚至导致鱼儿死亡。
生石灰消毒，一是干池消毒，排干水或留水深5～10厘米，用量为40～55公斤/亩。消毒时池塘的四周挖几个大小适宜的水塘，让水流入，再把生石灰放入溶化，趁热立即全池泼洒，次日用长柄泥耙在池底推耙一遍，使石灰浆与塘泥充分混合，以提高消毒效果。
二是带水消毒。生石灰用量为60～75公斤/亩，将生石灰溶化后趁热均匀全池遍洒。
