这句话是针对染色体上的基因而言的，原核生物以及真核生物的细胞质基因不存在这一说。
1、 情况一：当基因突变出现新基因后，由于它位于一条单链上，在与它碱基配对的另一条单链上也就有另外一个基因（即使不表达，但存在），这两个基因就是等位基因。
2 、情况二：当新基因与“突起物”形式存在时，它在复制产生子链时，同样又因碱基配对性，在新子链上也将“添出”另一个基因，这两个基因不也是等位基因吗。
3 、实际上由于碱基配对规律的必然性，单链DNA上的基因，碱基配对后另一链上的相同位点又出现的基因，是突变基因的等位基因。所以说基因突变“结果仅仅产生等位基因”——新的基因及其新的等位基因。这里并不是说仅仅产生原来旧基因的等位基因。（原话中没有“旧基因”字眼），不可局限。 没有“单股链DNA”存在，也就不能有只存在于这条“单股”链DNA上的“独立基因”存在。
