工程师证（或者是助理工程师）不能替代施工员证，这是两个不同有概念，二者不可相互替代。
工程师证是证明你的专业技术水平，比如某人是做设计的，职称为工程师，不一定能做施工员。施工员证是岗位资格，说明能胜任某个工作岗位，但技术水平不一定达到工程师的要求。
施工员：属于职业资格初级上岗证，一般在施工单位项目部从事施工管理/指导/技术工作。 工程师：属于工程技术系列初级职称，一般在机关企事业单位从事工程技术管理
工作。
工程师证书是职称证书，说明您有这样的能力，施工员证是上岗证书，说明允许您从事施工员这个岗位。两者间没有因果的或链接的关系。
