分子键和原子键是化学中两种不同的键合方式，它们在本质上有一些区别。
分子键主要涉及分子之间的相互作用。分子是由组成的原子通过化学键合而形成的整体。这些分子键合是通过共享电子来实现的，而这些电子在原子间形成了一种相互吸引的力量。分子键的性质，如键能、键长和键角，反映了分子的物理和化学性质。
另一方面，原子键是指原子之间的相互作用，这种作用是通过共享电子来实现的。在原子键中，原子核与电子之间的相互作用提供了保持原子稳定和构成分子的力量。
总结来说，分子键主要涉及分子之间的相互作用，而原子键则涉及原子之间的相互作用。它们在化学和物理性质上的表现有明显的不同。
原子键有有离子键、共价键、金属键，还有分子键（范德华键），氢键等五种。
化学键是纯净物分子内或晶体内相邻两个或多个原子（或离子）间强烈的相互作用力的统称。使离子相结合或原子相结合的作用力通称为化学键。
离子键、共价键、金属键各自有不同的成因，离子键是通过原子间电子转移，形成正负离子，由静电作用形成的。共价键的成因较为复杂，路易斯理论认为，共价键是通过原子间共用一对或多对电子形成的，其他的解释还有价键理论，价层电子互斥理论，分子轨道理论和杂化轨道理论等。金属键是一种改性的共价键，它是由多个原子共用一些自由流动的电子形成的。
