北京钟鼓楼始建于元代至元九年（即公元1272年），当时位置处于在大都城（即今北京）的中心，后毁于火。
元成宗大德元年（公元1297年）重建之后又毁于火。
明永乐十八年（公元1420年）重建钟鼓楼，并确立了其位于都城南北中轴线北端的地位。后相继毁于火。
嘉靖十八年（1539年）鼓楼遭雷击起火，第三次重修。
清乾隆十年（1745年）再次重建钟楼。钟鼓楼在清代历经修复，所见到的鼓楼建于明代，钟楼则建于清代。
1932年和1941年前后，为保护建筑并有效地利用，对钟鼓楼进行了不同规模的修缮。1984年国家拨款对钟鼓楼进行大规模的修缮，1986年成立钟鼓楼文物保管所，负责该文物建筑的保护管理与利用。
