珍珠奶茶中含有乳制品、茶和糖浆等成分，如果未经保鲜处理，放置时间过久或者保存不当，容易出现变质和污染的风险。加上珍珠奶茶中的珍珠属于低温保存食品，如果放置时间过长，可能会导致珍珠发霉变质。
一般来说，自家调制的珍珠奶茶最好在饮用前1-2个小时内饮用完。如果需要保存，可以将其放入密封的保鲜袋中，放置于0-5℃的冰箱中保存，最好在24小时内食用完。同时需要注意，冰箱中存放珍珠奶茶的温度不要太低，以免珍珠硬化变质。如果发现有异味或者异常，应立即丢弃。
如果是在商店购买的已经包装好的珍珠奶茶，一般上面都标有保质期，最好按照说明存放和食用，如果超过保质期，最好不要再食用。
珍珠奶茶保存的时间和所处的温度有关，如果将珍珠奶茶放在常温比较热的环境中存放，可以存放半天至一天的时间，将珍珠奶茶放在阴凉的环境中或是冰箱冷藏，可以存放一天左右。喜欢喝口感清凉的珍珠奶茶，可以添加一些冰块，这样喝下来会更加清爽。
