施耐庵晚年告别官场，携家眷隐逸山野，故而他的子嗣并未有详细记载，但坊间谣传施耐庵的三代子孙皆为哑巴，未曾有详实的史书资料，听其言以颇为荒诞，故而不可听信。
因施耐庵在中国古代小说上的文学成就甚高，所以调查其生平事迹极为紧要，1952年文化部组织了施耐庵调查组，前往施耐庵遗迹进行实地勘察，起先关注家谱的历史传承与资料来源，搜集现成已有的施氏资料，从施耐庵墓志铭等多处开始着手，然后整理当地县志中关于施氏一族的来龙去脉。
接下来，多方搜集家谱版本并著录其间的差别，共著录了六个访得的《施氏支谱》，其中最为重要的就是《施祥珠本》，其中对施耐庵后人有详细的记载。
经过资料的整理与审核，确定了施耐庵后人的香火继承，根据这些史料记载，可以确定施耐庵后人乃仁义之辈，子孙兴旺。
