通常根据合同约定和法律法规来确定。以下是一些常见的工程付款方式：
1. 一次性付款：工程完工后一次性支付全部款项。
2. 分期付款：按照工程进度分期支付款项，一般按月或按季度支付。
3. 进度付款：根据工程进度和合同约定，按照一定的比例和时间支付款项。
4. 质保金：在工程完工后，保留一部分款项作为质保金，一般在合同约定的质保期结束后支付。
5. 垫资：承包商垫资建设，在工程建设过程中逐步收回投资，并在工程完工后获得工程款项。
在实际操作中，工程付款方式会根据具体情况和合同约定有所不同。在签订合同时，双方应明确约定工程付款方式、支付时间、支付比例等相关事项，以避免后续纠纷。同时，为确保款项支付的合理性和合法性，建议在合同中明确约定款项的用途、支付对象和支付时间等细节。
通常根据合同类型、工程进度、验收节点、发票开具等情况来决定。一般来说，可以采取以下几种方式：
1. 阶段性付款：根据工程进度，按照合同约定的时间和比例分期支付工程款项。这种方式能够减轻一次性付款的压力，有利于工程进度的控制和监督。
2. 竣工后付款：工程竣工并验收合格后，支付全部或部分余款。这种方式有利于保证工程质量，减少后期纠纷。
3. 垫资施工：建设单位在工程开工前，要求施工方垫付一定比例的资金进行施工。这种方式对施工方来说风险较大，需要谨慎考虑。
4. 进度款和结算款支付方式：施工单位按合同约定提交进度报表，建设单位在收到报表后一定时间内审核并支付相应款项。工程竣工后，施工单位提交结算报告，建设单位审核并在一定时间内支付结算款。这种方式有利于对工程进度的跟踪和控制。
5. 跨周期付款：适用于大型工程项目，分期、分阶段进行施工和付款，能够减轻建设单位的资金压力。
6. 质保金/质量保证金：在工程款项中预留一定比例的资金作为质保金/质量保证金，以确保工程质量。待工程质保期满后，若无质量问题，再支付这部分资金。
7. 第三方托管/银行保函：通过第三方托管或银行保函的形式，确保工程款项的支付安全。
8. 按揭付款：适用于分期建设的工程项目，按照工程进度和资金需求情况，分期支付工程款项。
9. 一次性付款：适用于小型工程项目或紧急情况，一次性支付全部工程款项。
10. 其他定制化付款方式：根据具体项目需求和合同约定，可以协商制定个性化的工程付款方式。
在选择工程付款方式时，应充分考虑项目的实际情况、风险控制、资金流动等因素，以达成双方都能接受的解决方案。此外，还需要严格遵守相关法律法规和税收政策，确保合法合规地进行工程款项的支付和处理。同时，加强沟通和协作，确保双方在付款方式和时间安排上达成一致，以促进项目的顺利进行。
需要注意的是，在实际操作中可能存在各种复杂因素和风险点，如合同履行不当、工程质量问题、资金流动不稳定等。因此，在确定工程付款方式时，需要充分了解项目的背景和实际情况，评估各种因素对项目的影响程度，并采取相应的风险控制措施。同时，加强与合作方的沟通和协商，确保双方权益得到保障并达成合作共赢的局面。
