（1）燃烧系统不同
大众在EA888三代低功率版本上为了优化油耗采用了和高功率不同的燃烧系统。由于高功率的EA888 Gen3采用传统的奥托循环，而低功率的EA888 Gen3B使用了米勒循环来降低油耗，因此两者的活塞，缸盖燃烧室，缸盖气道，喷油器等都是不同的。
（2）压缩比差异也比较大
低功率的EA888 Gen3B由于采用米勒循环，压缩比比较高达到11.7，而传统米勒循环的高功率的EA888 Gen3压缩比只有9.8。
（3）可变气门升程AVS设计的差异
高功率的EA888 Gen3的气门可变升程系统AVS在排气侧，主要是为了提升低速性能和增压器动态响应。低功率的EA888 Gen3B的气门可变升程系统AVS是在进气侧，主要是为了实现米勒循环的低凸轮升程要求，同时减少米勒循环带来的最大功率损失。
