灰原哀是漫画中的重要人物，在名侦探柯南中出场的集数包括：136集《黑暗组织来的女子大学教授杀人事件》出场后，几乎每集都有。
371-375集《与黑衣组织面对面对决满月之夜的双重事件》、435集《珠宝强盗现行犯上集》、459-463集《黑色冲击！组织之魔爪触碰的瞬间》、539-550集《红与黑的碰撞血缘》、572-573集《新一的真实身份和小兰的眼泪》、753-756集《漆黑的神秘列车》
129 来自黑暗组织的女子
灰原哀第一次出场，吃了药从宫野志保变成小学生灰原哀，并且转学和柯南成为同班同学，成为柯南的搭档。
136 ～137 蓝色古堡探索事件
阿笠博士带着少年侦探团的小孩一起去野营，结果因为没有带帐篷大家就在一个山中的古堡留宿。
