百合根腐病的防治分为两种:农业防治和化学防治。
一:农业防治
1:栽种前选择优良种种球，剔出有病的，有受伤的，感染了病菌的种球。从而从初期减少种球的感染。
2:选择容易排水，相对地势要高的育种地块。
3:氮肥要少量施撒，增加磷肥和钾肥的施撒，从而促进植株的健壮，提高植株的抗病性。
4:作物轮作，选非百合科的植物进行轮作，轮作时间以3年或3年以上为主。
5:收获百合后，剔除那些带病伤残的组织，清除带有病原体的病株，移出田间地头。
二:化学防治
1:土壤进行消毒处理。种植鳞茎之前，对土壤进行消毒处理，从而达到减少土壤中病菌的数量。
2:防治地下的害虫。使用生物农药，对地下的害虫进行防治。
3:种球的处理。使用药物对种球进行浸种后再晾晒。（可用国光多菌灵+重荐宝兑水）
4:药剂防治。使用药剂对苗期进行喷雾，从而促进根系生长有效防治百合根腐病。（苗期，苗高15-20cm，建议使用根宝+优丰+重茬宝+国光艾德，兑水进行喷雾）。
百合根腐病的防治方法。
可以从以下两方面进行防治：
一、农业防治
（1）栽种前精选种球，剔除病、伤鳞茎，感染病菌的种球都不能用，减少初侵染源。
（2）选择地势高、易排水的田块，高畦深沟、排水通畅的田块种植百合。
（3）少施氮肥，增施磷钾肥，促进植株健壮，提高植株抗病力。
（4）合理轮作，病菌随病残体可在土壤中存活1-3年，与玉米、马铃薯等非百合科类作物实行3年轮作倒茬。
（5）收获后及时清除病残组织，将病株清理出田间。
二、化学防治
（1）土壤消毒；种植鳞茎之前，使用国光三灭进行土壤消毒，减少土壤中病菌数量。注意：使用三灭后，半个月以内不能下种。
（2）防治地下害虫；用辛硫磷等颗粒药物混施底肥防治好地下害虫，并每亩使用国光金美根防治线虫；苗期使用国光毒箭兑水进行叶面喷施，可有效防治地下害虫。
（3）种球处理；种植前使用国光多菌灵+重茬宝兑水浸种，晾干后再进行播种。
（4）药剂防治：苗期（苗高15-20cm）使用根宝+优丰+重茬宝+国光艾德，兑水进行喷雾，可以促进根系的生长，有效防治百合根腐病。
