1250KVA变压器是否可以使用1006铜排需要根据实际情况来确定。根据常规的经验，一般情况下，1250KVA变压器可以使用1006铜排作为高压侧的母线，但是具体还需要考虑以下因素：
变压器容量和额定电流：变压器的容量和额定电流是选择母线的重要依据。1250KVA变压器的高压侧额定电流约为72A。如果该铜排的载流量能够满足这个电流值，那么就可以使用。
铜排的散热条件：铜排的散热条件对它的载流量和使用寿命都有影响。如果铜排所在环境的散热条件较好，那么就可以使用；如果散热条件较差，那么就需要考虑其他方案。
变压器运行情况：变压器在实际运行中可能会产生过载情况，这也会影响铜排的选择和使用。如果变压器经常过载运行，那么就需要选择更高规格的铜排或者采取其他措施来保证安全。
综上所述，1250KVA变压器是否可以使用100*6铜排需要根据实际情况来决定。如果铜排的载流量、散热条件和变压器运行情况都满足要求，那么就可以使用。如果不确定是否可以使用，建议咨询专业人士的意见。
