二者的主要区别如下：
第一、 山茱萸和羊奶果的科属种类不一样：其中山茱萸是山茱萸科山茱萸属植物，而羊奶果是蔷薇目胡颓子科植物的果实。
第二、 山茱萸和羊奶果的外观大小不一样：其中山茱萸是落叶乔木或灌木，其植株树皮灰褐色；小枝细圆柱形，无毛。叶对生，纸质，上面绿色，无毛，下面浅绿色；伞形花序生于枝侧，总苞片卵形，带紫色；核果长椭圆形，红色至紫红色；核骨质，狭椭圆形，有几条不整齐的肋纹；而羊奶果植株为多年生常绿攀援灌木，果实鲜红色至紫红色，鲜果生食。
第三、 山茱萸和羊奶果的口味用途不一样：山茱萸果实味酸涩，性微温，常用作收敛性强壮药；而羊奶果甜酸适度可口，水分充足，可用于食用。
