《魔道祖师》背后真相涉及金光瑶、魏无羡、江澄、温宁等人，以及一些重要事件如穷奇道截杀和观音庙的剧情等。
金光瑶是隐藏的最后一个boss，观音庙是最后一个副本，观音庙剧情完结后，漫画《魔道祖师》也即将完结。在观音庙的剧情中，揭露了金光瑶的罪行，他的“杀妻杀子杀师杀友”的行为，其实是因为他出生低下，受尽嘲讽和冷眼，还有一个不断惹事的父亲，使得他不得不这么做。
另外，在剧情中，江澄的情绪受到了金丹的真相的冲击，他此时已经无法淡定，而魏无羡因为刺激而旧伤复发，蓝湛只能出手阻止。还有著名的偷鸡摘枣和乱写乱画等情节也还原了原著。
穷奇道截杀和金光瑶的手笔也是《魔道祖师》背后的真相之一。
魔道祖师》主要人物结局：蓝忘机和魏无羡是官方CP，两人最后在一起了。金光瑶作恶多端，为了救蓝曦臣被凶尸聂明玦杀死。蓝曦臣回到蓝家后开始闭关，曾经温润如玉的人最后变得郁郁寡欢。江澄和魏无羡世纪大和好，依然当他的江家宗主。晓星尘自杀而死，魂魄碎片被薛洋收集起来了。聂怀桑是幕后大boss，真面目直到最后才被揭开。
