1、岳麓书院，位于长沙市湘江畔岳麓山下，是我国古代四大书院之一。
2、白鹿洞书院，位于江西九江庐山五老峰南麓的后屏山之阳，江西省星子县内。
3、嵩阳书院，在河南省郑州登封市嵩山南麓，创建于北魏孝文帝太和八年时，时称嵩阳寺，至唐代改为嵩阳观，到五代时周代改建为太室书院。
4、应天府书院，又睢阳书院，前身南都学舍，原址位于河南省商丘县城南，今天应天府书院只剩下残存的建筑，供人瞻仰。
5、鹅湖书院，位于江西铅山县鹅湖山麓，山为武夷支脉，因山上的鹅湖得名。
五个书院分别为日新书院、致理书院、探微书院、未央书院、行健书院。其中，日新书院负责基础文科类专业的人才培养，致理书院负责基础理科学术类专业的人才培养，探微、未央和行健三个书院则负责基础理科工程衔接类专业，分别对接化学生物学、数理基础科学和理论与应用力学三个专业方向。
