南京城门有“里十三、外十八”之称。
南京内城城门自东南向西北顺时针依次是：朝阳门（今中山门）、正阳门（今光华门）、通济门、聚宝门（今中华门）、三山门（今水西门）、石城门（今汉中门稍南的汉西门）、清凉门（又称清江门）、怀远门（今定淮门）、仪凤门（今兴中门）、钟阜门、金川门、神策门（今和平门）、太平门，这就是常说的“里十三”。
自清朝至今又先后在内城增辟草场门、丰润门（今玄武门）、挹江门、武定门、汉中门、解放门等等。而明朝所开的城门今仅存聚宝（中华门）、石城（今汉中门稍南的汉西门）、神策（今和平门）、清凉四门。 “外十八”指南京外廓的城门，城垣本体以丘陵、垒土为主，只在城门等一些防守的薄弱地段加筑城砖，所以俗称“土城头”。
从东郊的麒麟门起，向北经过仙鹤门、姚坊门（今尧化门）、观音门、佛宁门、上元门，直到江边的外金川门；从麒麟门往南，经过沧波门、高桥门、上方门、夹岗门、凤台门、大安德门、小安德门、大驯象门、小驯象门、江东门和栅栏门，也止于江边。由于城垣设施简陋，这座外城早已被毁，但人们仍然使用这些城门的名称来作为当地的地名。
南京的古明城墙目前共有13个城门，分别是:
朝阳门、聚宝门、通济门、正阳门、三山门、石城门、清凉门、定淮门、仪凤门、太平门、神策门、金川门、钟阜门。
