飞机行程单的电子版和纸质版主要在以下几个方面有区别：
1.格式：电子版行程单是以电子文件的形式存在，一般为PDF或者电子票等格式，而纸质版行程单是以纸质文件的形式存在。
2.获取方式：电子版行程单可以通过航空公司官方网站、电子邮件等途径进行下载和获取，而纸质版行程单一般是由航空公司提供，通过邮寄或者在机场柜台领取。
3.重要性：纸质版行程单一般比较重要，是登机的必备文件之一，需要在登机口出示。而电子版行程单通常只作为乘客的电子备份，一般不需要实际出示。
4.可读性：纸质版行程单直接印刷在纸上，具有较好的可读性，而电子版行程单可能因为屏幕大小、分辨率等因素影响可读性。
5.易保存：电子版行程单可以随时保存在电脑、手机等设备上，方便查阅和备份。而纸质版行程单可能需要特别保存，以免丢失或损坏。
总的来说，电子版行程单更加便捷和环保，而纸质版行程单则更重要，需要在登机过程中出示。
区别是：普通的行程单是有形的纸质形式，而电子发票是其进一步的简化，无形。
行程单分为电子行程单和纸质行程单，由国家税务总局统一负责管理。后来的电子客票是商务初期市场化的最佳产品，摆脱了传统的物流配送环节，与纸质发票相比，减少了预定的费用，也降低了文件丢失和地址寄送错误的可能性。目前中国电子发票业务发展的很好，比例接近百分之百。
