1、用途不同
JS防水涂料：主要用于市政、建筑工程的防水、抗渗、补漏、隔热、装饰。聚氨酯防水涂料主要用作聚氨酯合成革、聚氨酯泡沫塑料、聚氨酯涂料、聚氨酯粘合剂、聚氨酯橡胶（弹性体）和聚氨酯纤维等。
2、特点不同
JS防水涂料：为绿色环保材料，不污染环境，性能稳定，耐老化性优良，防水寿命长；使用安全，施工方便，操作简单，可在无明水的潮湿基面直接施工。聚氨酯：较高的机械强度和氧化稳定性；具有较高的柔曲性和回弹性；具有优良的耐油性、耐溶剂性、耐水性和耐火性。
3、成分不同
JS防水乳胶是高分子聚合物丙烯酸酯类防水涂料，属于改进型JS复合防水涂料液料。
聚氨酯，是在大分子主链中含有氨基甲酸酯基的聚合物称为聚氨基甲酸酯，聚氨酯分为聚酯型聚氨酯和聚醚型聚氨酯两大类。
