部门层级的区别主要取决于组织的结构和管理方式，常见的有以下几种类型：
1. 职能型部门：这是一种按专业领域划分的层级型组织结构。每个职能部门通常都由该专业的专家担任职能经理，该经理是部门员工的唯一直接上线。职能型组织是最传统的组织结构，在职能型组织中做项目，必须把项目放到某个职能部门中，由该部门的员工兼职完成 。
2. 项目型部门：项目型部门也具有层次结构，但在这个结构下，不是职能经理和主管副总裁对CEO负责，而是项目经理直接对CEO负责。他们手下的人员具有完成特定项目所需的各种技能 。
3. 矩阵型组织：矩阵型组织是介于职能型结构和项目型结构之间的组织结构。公司员工通常既要对职能经理负责，又要向至少一位以上的项目经理汇报。
此外，还有一种常见的组织形式是层级制，即企业按照职位等级高低进行组织管理的方法。在层级制中，企业的管理层次分为多个等级，每个等级拥有不同的职责与权限 。
这些部门层级的区别主要在于他们的管理方式和职责分配，不同的部门层级适用于不同的组织结构和管理需求。
部门的层级只是职能职责的区别，级别没有区别。一般一个部门设几科一室，或几部一室等。如部门层级有财务科（部）、审计科（部），政宣科（部），生产科（部）、营销科（部），办公室等。
