有区别。
一是果肉颜色不同，红肉脐橙果肉粉红色至红色，二是味道不同，红肉脐橙有特殊香味，含有大量水分，白肉脐橙清香气味和水分不如红肉脐橙，但白肉脐橙要比红肉脐橙甜；
三是所含养份不同，红肉脐橙含有大量的维生素C，番茄红素等，具有抗氧化作用，白肉脐橙
红肉脐橙相对于白肉脐橙来说，其中的维生素C含量更高，而且还含有白肉脐橙没有的番茄红素，因此从营养的角度来说，红肉脐橙更好一些。
由于红肉脐橙中的维生素C含量更高，吃起来酸味更重，所以一般白肉脐橙的甜度要略高于红肉脐橙，食用起来的味道和口感会更好一些。
