宝山的气候为寒温带大陆性季风气候，冬季寒冷而漫长，夏季短且温热多雨，自建区有统计记载以来，年平均气温一般为2.4℃，最冷月平均气温－17℃，最热月平均气温22℃。一年间最低气温出现在1月份，极端最低气温－39.4℃（1969年1月23日）；一年间最高气温出现在七、八月份，极端最高气温36.5℃（1978年7月2日）。全年无霜期为126天左右，早霜期一般从9月19日开始，终霜期一般到5月20日结束；年平均降水量532.1毫米；全年平均日照时间在7小时左右，最长日照时间可达14小时（农历夏至）；风向以西南风（夏季）和西北风（冬季）为主，最大风速可达25米∕秒。宝山区域内出现冰雹的次数较少，分布面积不广，但对农作物仍有一定危害性。宝山区域内的地形比较复杂，有山脉、平地与丘陵，且山脉走向不一致，峰谷交错，地形变化较大。
