不是一个意思。自相矛盾表示说的话或者行为出现明显的矛盾,例如“我不喜欢吃葡萄,但每次看到葡萄就忍不住吃”。漏洞百出则表示缺少完整、严密或者正确的论据或者信息,存在许多问题或者不足之处,例如“这篇论文的数据来源不明,结论缺乏说服力,漏洞百出”。