食品经营企业应当建立的食品安全管理制度包括:食品采购、进货查验、运输储存、生产经营记录制度,防止食品变质、超过保质期或者不安全食品流入企业,以及食品召回和处置制度等。此外,还应建立食品安全自查、食品安全追溯等制度。