湿度对胚胎的发育有很大的影响，它与蛋内水分蒸发和胚胎物质代谢有密切的关系。
在孵化过程中若湿度不足，蛋内水分会加速向外蒸发；若湿度过高又会阻碍蛋内水分蒸发，湿度过高过低都会破坏胚胎的正常物质代谢。在整个孵化过程中，胚胎对湿度的要求是前、后期高、中期低，即“两头高中间低”。一般在孵化1～8天相对湿度以70%为宜，9～16天降低为60%～65%，17～24天为50%～55%，25～28天又提高到70%。如长期分批入孵，相对湿度宜控制在60%～65%。出雏时，足够的湿度能促进空气中二氧化碳和碳酸钙作用，使蛋壳变为碳酸氢钙，蛋壳变脆，有利于雏鸭啄孔破壳，还能防止雏鸭绒毛与蛋壳粘连。现代全自动孵化机已安装自动控湿装置，只需连接水箱即可。
