西瓜汁分层现象一般分为两种情况：
一种是沉淀在下面的分层。西瓜汁属于水和大分子果粒等难溶性物质组成的一种混合物，静置一段时间后难溶性物质会沉淀下来。
还有一种是大分子果粒漂在上层的分层。上面一层里有部分的西瓜的果肉微粒，因此颜色比较深，并且，在榨汁机高速旋转时，果肉被打碎，飞溅时接触空气，产生一些泡沬样的感觉，所以漂在上层。而下面是果汁，里面颜色深的果粒都漂到上层去了，所以感觉比较淡。但味道是下面的果汁更好喝。
这是因为果汁与含渣层分离。 其它鲜榨西瓜汁或多或少都有些果肉在里面，久了就重的下沉，轻的上浮。 西瓜汁是由水和大分子果粒等难溶性物质组成的混合物质,在静置一段时间后难溶性物质沉淀下来,产生分层现象。
西瓜瓜瓤在包含果汁的同时也包含果肉，尽管经过榨汁机的作用，还是会有少量的果肉连同果汁一起被分离出来。
混在果汁里面的果肉很小很小，和果汁混在一起会漂浮在果汁的上方，透光性较差，看上去颜色较深；而下面是果汁，颜色较浅，因此看上去给人一种分层的感觉。
