人事代理人员和编制内的在编人员的区别在于两类人员各属于不同的单位，两类人员之间的联系就是同时为某一机构或者社会组织服务。
所谓人事代理人员就是由人事代理公司派遣到用人单位的工作人员，俗称派遣工，其工资和保险福利等由用人单位支付给人事代理公司，在由人事代理公司扣除人事代理佣金以外，负责发放派遣人员的薪资和福利待遇，负责缴纳派遣人员的社会保险。
而编制内的在编人员的薪资、社会保险福利等由所服务的单位负责。
1、在含义上不同:人事代理是指政府人事部门批准或授权的人才中介服务接受各类用人单位或个人委托，为其代理有关人事业务；事业编制是事业单位编制的总称，像学校就是典型的事业单位；
2、在类型上不同:人事代理就是将过去由用人单位直接管理的一部分人事业务分离出来，委托政府人事部门所属人才服务机构来承担，单位只管用人；事业单位分为自收自支、差额拔款、全额拔款三种类型。
3、在性质上不同:人事代理是一些技术性、专业性、事务性、咨询性的具体人事业务工作，由人才中心给予统一代理；事业编制参照公务员法管理事业单位：使用事业编制，但须参加公务员考试。
