最大的区别在于普通签证只能前往申请国，而申根签证是欧洲申根国任何一国签证的附属签证。
比如，签法国。你递交法国签证申请表的时候，说明你要申请申根签证。必须附加填写一张表格，这样下来，你的法国签证上面会有申根签证的说明。
申根签证：是指根据申根协议而签发的签证。这项协议由于在卢森堡的申根签署而得名，它规定了成员国的单一签证政策。据此协议，任何一个申根成员国签发的签证，在所有其他成员国也被视作有效，而无需另外申请签证。现在申根国家颁布给中国公民的旅游签证都属于申根短期签证，既在申根国家的停留期不能超过90天的签证。
普通签证：是一国政府主管机关依法为进人或经过该国国境应当给予普通人员待遇的人士所颁发的签证。普通签证一般发给持普通护照或其他有效的国际旅行证件的人员。
